El Programa de Ingeniería de Sistemas de la Corporación Universitaria Rafael Núñez, inicia labores en febrero de 1.997. Desde el año 2003 se han incorporado docentes con funciones de coordinación en las áreas de formación, proyección social y de investigación, que poseen cualificación profesional y especializada en diferentes áreas de la ingeniería. La planta docentes actual cuenta con un docente doctor,  docentes estudiantes de doctorado, y estudiantes de maestría.

El Programa de Ingeniería de Sistemas esta comprometida con el mantenimiento y la evolución de  la investigación formativa y estricta de su comunidad académica, esto reflejado en su producción tecnológica y científica  registrada en Colciencias por su  reconocimiento al  grupo de Investigación en Categoría B.

La proyección  social se desarrolla con proyectos de impacto social con estudiantes voluntarios  en las Zonas de Influencia, en municipios y en los corregimientos insulares de Cartagena. Con la Práctica Profesional de nuestros estudiantes se contribuye al mejoramiento y tecnificación de los procesos en las empresas del sector educativo, industrial, y en entidades públicas y privadas.